MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pLeu

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017261	TGTT	2	8	332	339	0 %	75 %	25 %	0 %	384228028
2	NC_017261	T	7	7	378	384	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
3	NC_017261	CTA	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
4	NC_017261	GAA	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
5	NC_017261	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
6	NC_017261	TCT	2	6	498	503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
7	NC_017261	T	6	6	547	552	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
8	NC_017261	ATCC	2	8	631	638	25 %	25 %	0 %	50 %	384228028
9	NC_017261	TTG	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228028
10	NC_017261	T	6	6	648	653	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
11	NC_017261	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
12	NC_017261	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	384228028
13	NC_017261	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228028
14	NC_017261	T	6	6	753	758	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
15	NC_017261	TAAT	2	8	797	804	50 %	50 %	0 %	0 %	384228028
16	NC_017261	ATTT	2	8	824	831	25 %	75 %	0 %	0 %	384228028
17	NC_017261	TCA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
18	NC_017261	GAA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
19	NC_017261	TTCA	2	8	963	970	25 %	50 %	0 %	25 %	384228028
20	NC_017261	TCT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
21	NC_017261	T	8	8	983	990	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
22	NC_017261	AATTTT	2	12	999	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
23	NC_017261	T	7	7	1007	1013	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
24	NC_017261	TAATT	2	10	1027	1036	40 %	60 %	0 %	0 %	384228028
25	NC_017261	TTA	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
26	NC_017261	AGG	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228028
27	NC_017261	A	6	6	1122	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	384228028
28	NC_017261	GGGATT	2	12	1128	1139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384228028
29	NC_017261	A	9	9	1406	1414	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
30	NC_017261	A	6	6	1418	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
31	NC_017261	AT	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
32	NC_017261	TA	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
33	NC_017261	TAT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228029
34	NC_017261	T	6	6	1513	1518	0 %	100 %	0 %	0 %	384228029
35	NC_017261	CAA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228029
36	NC_017261	TTTA	2	8	1527	1534	25 %	75 %	0 %	0 %	384228029
37	NC_017261	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
38	NC_017261	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
39	NC_017261	GTT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
40	NC_017261	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
41	NC_017261	A	6	6	1685	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
42	NC_017261	GGAT	2	8	1696	1703	25 %	25 %	50 %	0 %	384228029
43	NC_017261	GATG	2	8	1710	1717	25 %	25 %	50 %	0 %	384228029
44	NC_017261	A	6	6	1728	1733	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
45	NC_017261	CAT	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228029
46	NC_017261	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
47	NC_017261	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228029
48	NC_017261	ATA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228029
49	NC_017261	ATTAT	2	10	1819	1828	40 %	60 %	0 %	0 %	384228029
50	NC_017261	AT	3	6	1875	1880	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
51	NC_017261	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
52	NC_017261	A	6	6	2072	2077	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
53	NC_017261	AT	3	6	2082	2087	50 %	50 %	0 %	0 %	384228030
54	NC_017261	T	6	6	2100	2105	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
55	NC_017261	A	9	9	2122	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
56	NC_017261	TAAAT	2	10	2189	2198	60 %	40 %	0 %	0 %	384228030
57	NC_017261	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
58	NC_017261	T	6	6	2435	2440	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
59	NC_017261	A	7	7	2466	2472	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
60	NC_017261	ATA	2	6	2476	2481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
61	NC_017261	ATA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
62	NC_017261	A	7	7	2505	2511	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
63	NC_017261	T	6	6	2529	2534	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
64	NC_017261	A	9	9	2554	2562	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
65	NC_017261	ATT	2	6	2566	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
66	NC_017261	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
67	NC_017261	A	7	7	2584	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
68	NC_017261	AGA	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228030
69	NC_017261	A	6	6	2614	2619	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
70	NC_017261	TC	3	6	2624	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	384228030
71	NC_017261	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
72	NC_017261	A	8	8	2678	2685	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
73	NC_017261	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
74	NC_017261	ATT	2	6	2704	2709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
75	NC_017261	CAGC	2	8	2713	2720	25 %	0 %	25 %	50 %	384228030
76	NC_017261	A	8	8	2751	2758	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
77	NC_017261	GATA	2	8	2759	2766	50 %	25 %	25 %	0 %	384228030
78	NC_017261	TA	3	6	2791	2796	50 %	50 %	0 %	0 %	384228030
79	NC_017261	TTA	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
80	NC_017261	AGCA	2	8	2994	3001	50 %	0 %	25 %	25 %	384228031
81	NC_017261	A	6	6	3135	3140	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
82	NC_017261	A	6	6	3142	3147	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
83	NC_017261	TAG	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
84	NC_017261	T	7	7	3240	3246	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
85	NC_017261	CAACAT	2	12	3249	3260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384228031
86	NC_017261	A	6	6	3283	3288	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
87	NC_017261	T	6	6	3315	3320	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
88	NC_017261	AG	3	6	3327	3332	50 %	0 %	50 %	0 %	384228031
89	NC_017261	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
90	NC_017261	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228031
91	NC_017261	ATTT	2	8	3504	3511	25 %	75 %	0 %	0 %	384228031
92	NC_017261	CTA	2	6	3537	3542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
93	NC_017261	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
94	NC_017261	AGA	2	6	3670	3675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
95	NC_017261	AGA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
96	NC_017261	TAG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
97	NC_017261	TAG	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
98	NC_017261	GTA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
99	NC_017261	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228031
100	NC_017261	TCA	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
101	NC_017261	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
102	NC_017261	A	7	7	3910	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
103	NC_017261	AGC	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228031
104	NC_017261	ATGA	2	8	3968	3975	50 %	25 %	25 %	0 %	384228031
105	NC_017261	TGA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
106	NC_017261	T	6	6	4024	4029	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
107	NC_017261	A	6	6	4043	4048	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
108	NC_017261	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
109	NC_017261	ACA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228031
110	NC_017261	T	6	6	4130	4135	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
111	NC_017261	TAA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
112	NC_017261	ATT	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
113	NC_017261	A	7	7	4193	4199	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
114	NC_017261	TA	3	6	4200	4205	50 %	50 %	0 %	0 %	384228031
115	NC_017261	CTA	3	9	4215	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
116	NC_017261	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
117	NC_017261	A	6	6	4361	4366	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
118	NC_017261	ATA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
119	NC_017261	TAA	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
120	NC_017261	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
121	NC_017261	A	7	7	4486	4492	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
122	NC_017261	AAT	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
123	NC_017261	TAC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228032
124	NC_017261	A	6	6	4635	4640	100 %	0 %	0 %	0 %	384228032
125	NC_017261	TGC	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228032
126	NC_017261	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228032
127	NC_017261	A	8	8	4719	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	384228032
128	NC_017261	TATTT	2	10	4755	4764	20 %	80 %	0 %	0 %	384228032
129	NC_017261	A	7	7	4779	4785	100 %	0 %	0 %	0 %	384228032
130	NC_017261	ATC	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228032
131	NC_017261	CTT	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228032
132	NC_017261	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	384228032
133	NC_017261	AT	3	6	4943	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	384228032
134	NC_017261	G	6	6	4969	4974	0 %	0 %	100 %	0 %	384228032
135	NC_017261	ATTT	2	8	4975	4982	25 %	75 %	0 %	0 %	384228032
136	NC_017261	A	9	9	5004	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	384228032
137	NC_017261	TAT	2	6	5044	5049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228032
138	NC_017261	GA	3	6	5160	5165	50 %	0 %	50 %	0 %	384228032
139	NC_017261	TA	3	6	5216	5221	50 %	50 %	0 %	0 %	384228032
140	NC_017261	ATT	2	6	5242	5247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228032
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.